Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf8Q9EQH4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf8Q9EQH4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf8Q9EQH4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf8Q9EQH4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf8Q9EQH4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf8Q9EQH4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf8Q9EQH4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf8Q9EQH4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf8Q9EQH4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf8Q9EQH4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf8Q9EQH4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf8Q9EQH4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf8Q9EQH4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf8Q9EQH4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf8Q9EQH4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf8Q9EQH4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf8Q9EQH4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf8Q9EQH4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf8Q9EQH4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf8Q9EQH4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Taf8Q9EQH4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf8Q9EQH4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf8Q9EQH4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf8Q9EQH4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf8Q9EQH4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf8Q9EQH4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf8Q9EQH4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf8Q9EQH4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf8Q9EQH4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf8Q9EQH4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf8Q9EQH4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf8Q9EQH4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf8Q9EQH4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf8Q9EQH4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf8Q9EQH4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf8Q9EQH4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf8Q9EQH4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf8Q9EQH4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf8Q9EQH4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf8Q9EQH4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf8Q9EQH4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms