Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ80

Nif3l1, NIF3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nif3l1Q9EQ80 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nif3l1Q9EQ80 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nif3l1Q9EQ80 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nif3l1Q9EQ80 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nif3l1Q9EQ80 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nif3l1Q9EQ80 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nif3l1Q9EQ80 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nif3l1Q9EQ80 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nif3l1Q9EQ80 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nif3l1Q9EQ80 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nif3l1Q9EQ80 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nif3l1Q9EQ80 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nif3l1Q9EQ80 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nif3l1Q9EQ80 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nif3l1Q9EQ80 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nif3l1Q9EQ80 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nif3l1Q9EQ80 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nif3l1Q9EQ80 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nif3l1Q9EQ80 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nif3l1Q9EQ80 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nif3l1Q9EQ80 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nif3l1Q9EQ80 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nif3l1Q9EQ80 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.2 ms