Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clstn1Q9EPL2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clstn1Q9EPL2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clstn1Q9EPL2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clstn1Q9EPL2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clstn1Q9EPL2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clstn1Q9EPL2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Clstn1Q9EPL2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clstn1Q9EPL2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clstn1Q9EPL2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clstn1Q9EPL2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clstn1Q9EPL2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clstn1Q9EPL2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Clstn1Q9EPL2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clstn1Q9EPL2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Clstn1Q9EPL2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clstn1Q9EPL2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clstn1Q9EPL2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clstn1Q9EPL2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clstn1Q9EPL2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clstn1Q9EPL2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clstn1Q9EPL2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms