Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD06

Rarres2, Retinoic acid receptor responder protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres2Q9DD06 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rarres2Q9DD06 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rarres2Q9DD06 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rarres2Q9DD06 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rarres2Q9DD06 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rarres2Q9DD06 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rarres2Q9DD06 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rarres2Q9DD06 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rarres2Q9DD06 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rarres2Q9DD06 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rarres2Q9DD06 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rarres2Q9DD06 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rarres2Q9DD06 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rarres2Q9DD06 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rarres2Q9DD06 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rarres2Q9DD06 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rarres2Q9DD06 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rarres2Q9DD06 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rarres2Q9DD06 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rarres2Q9DD06 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms