Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csnk1dQ9DC28 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csnk1dQ9DC28 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csnk1dQ9DC28 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csnk1dQ9DC28 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csnk1dQ9DC28 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csnk1dQ9DC28 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csnk1dQ9DC28 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csnk1dQ9DC28 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csnk1dQ9DC28 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csnk1dQ9DC28 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csnk1dQ9DC28 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csnk1dQ9DC28 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csnk1dQ9DC28 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csnk1dQ9DC28 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csnk1dQ9DC28 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csnk1dQ9DC28 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csnk1dQ9DC28 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Csnk1dQ9DC28 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csnk1dQ9DC28 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csnk1dQ9DC28 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csnk1dQ9DC28 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csnk1dQ9DC28 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csnk1dQ9DC28 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csnk1dQ9DC28 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csnk1dQ9DC28 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csnk1dQ9DC28 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Csnk1dQ9DC28 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csnk1dQ9DC28 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Csnk1dQ9DC28 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csnk1dQ9DC28 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csnk1dQ9DC28 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csnk1dQ9DC28 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Csnk1dQ9DC28 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Csnk1dQ9DC28 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Csnk1dQ9DC28 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Csnk1dQ9DC28 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Csnk1dQ9DC28 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Csnk1dQ9DC28 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Csnk1dQ9DC28 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Csnk1dQ9DC28 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Csnk1dQ9DC28 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csnk1dQ9DC28 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csnk1dQ9DC28 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csnk1dQ9DC28 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csnk1dQ9DC28 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csnk1dQ9DC28 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csnk1dQ9DC28 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csnk1dQ9DC28 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csnk1dQ9DC28 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csnk1dQ9DC28 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Csnk1dQ9DC28 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms