Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ftsj3Q9DBE9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ftsj3Q9DBE9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ftsj3Q9DBE9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ftsj3Q9DBE9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ftsj3Q9DBE9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ftsj3Q9DBE9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ftsj3Q9DBE9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ftsj3Q9DBE9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ftsj3Q9DBE9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ftsj3Q9DBE9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ftsj3Q9DBE9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ftsj3Q9DBE9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ftsj3Q9DBE9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ftsj3Q9DBE9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ftsj3Q9DBE9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ftsj3Q9DBE9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ftsj3Q9DBE9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ftsj3Q9DBE9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ftsj3Q9DBE9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ftsj3Q9DBE9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ftsj3Q9DBE9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ftsj3Q9DBE9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ftsj3Q9DBE9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ftsj3Q9DBE9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ftsj3Q9DBE9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ftsj3Q9DBE9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ftsj3Q9DBE9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ftsj3Q9DBE9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ftsj3Q9DBE9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ftsj3Q9DBE9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ftsj3Q9DBE9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ftsj3Q9DBE9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ftsj3Q9DBE9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ftsj3Q9DBE9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ftsj3Q9DBE9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ftsj3Q9DBE9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ftsj3Q9DBE9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ftsj3Q9DBE9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ftsj3Q9DBE9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ftsj3Q9DBE9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ftsj3Q9DBE9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ftsj3Q9DBE9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ftsj3Q9DBE9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ftsj3Q9DBE9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ftsj3Q9DBE9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ftsj3Q9DBE9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ftsj3Q9DBE9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ftsj3Q9DBE9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ftsj3Q9DBE9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ftsj3Q9DBE9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ftsj3Q9DBE9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ftsj3Q9DBE9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ftsj3Q9DBE9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ftsj3Q9DBE9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ftsj3Q9DBE9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ftsj3Q9DBE9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ftsj3Q9DBE9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ftsj3Q9DBE9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ftsj3Q9DBE9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ftsj3Q9DBE9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ftsj3Q9DBE9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ftsj3Q9DBE9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ftsj3Q9DBE9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ftsj3Q9DBE9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms