Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA8

Amdhd1, Probable imidazolonepropionase, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amdhd1Q9DBA8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Amdhd1Q9DBA8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Amdhd1Q9DBA8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Amdhd1Q9DBA8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Amdhd1Q9DBA8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Amdhd1Q9DBA8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Amdhd1Q9DBA8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Amdhd1Q9DBA8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Amdhd1Q9DBA8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Amdhd1Q9DBA8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Amdhd1Q9DBA8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Amdhd1Q9DBA8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Amdhd1Q9DBA8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Amdhd1Q9DBA8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Amdhd1Q9DBA8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Amdhd1Q9DBA8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Amdhd1Q9DBA8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Amdhd1Q9DBA8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Amdhd1Q9DBA8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Amdhd1Q9DBA8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Amdhd1Q9DBA8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms