Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB94

Wdr53, WD repeat-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr53Q9DB94 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr53Q9DB94 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr53Q9DB94 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Wdr53Q9DB94 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms