Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smco2Q9DA21 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smco2Q9DA21 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smco2Q9DA21 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smco2Q9DA21 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smco2Q9DA21 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smco2Q9DA21 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smco2Q9DA21 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms