Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc70Q9D9B0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc70Q9D9B0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc70Q9D9B0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc70Q9D9B0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc70Q9D9B0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc70Q9D9B0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc70Q9D9B0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc70Q9D9B0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc70Q9D9B0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc70Q9D9B0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc70Q9D9B0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms