Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atg7Q9D906 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg7Q9D906 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg7Q9D906 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg7Q9D906 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg7Q9D906 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg7Q9D906 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg7Q9D906 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg7Q9D906 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg7Q9D906 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg7Q9D906 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg7Q9D906 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg7Q9D906 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg7Q9D906 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg7Q9D906 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg7Q9D906 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg7Q9D906 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg7Q9D906 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg7Q9D906 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg7Q9D906 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg7Q9D906 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atg7Q9D906 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg7Q9D906 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg7Q9D906 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atg7Q9D906 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg7Q9D906 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg7Q9D906 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg7Q9D906 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms