Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfaip8l2Q9D8Y7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.6 ms