Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnot8Q9D8X5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnot8Q9D8X5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnot8Q9D8X5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnot8Q9D8X5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnot8Q9D8X5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnot8Q9D8X5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnot8Q9D8X5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnot8Q9D8X5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnot8Q9D8X5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnot8Q9D8X5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnot8Q9D8X5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnot8Q9D8X5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnot8Q9D8X5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cnot8Q9D8X5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnot8Q9D8X5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnot8Q9D8X5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnot8Q9D8X5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnot8Q9D8X5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnot8Q9D8X5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnot8Q9D8X5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnot8Q9D8X5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnot8Q9D8X5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnot8Q9D8X5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnot8Q9D8X5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnot8Q9D8X5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnot8Q9D8X5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnot8Q9D8X5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnot8Q9D8X5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnot8Q9D8X5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnot8Q9D8X5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnot8Q9D8X5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnot8Q9D8X5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnot8Q9D8X5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnot8Q9D8X5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnot8Q9D8X5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms