Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chmp5Q9D7S9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chmp5Q9D7S9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chmp5Q9D7S9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chmp5Q9D7S9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chmp5Q9D7S9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chmp5Q9D7S9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chmp5Q9D7S9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chmp5Q9D7S9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chmp5Q9D7S9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chmp5Q9D7S9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chmp5Q9D7S9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chmp5Q9D7S9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chmp5Q9D7S9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chmp5Q9D7S9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chmp5Q9D7S9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chmp5Q9D7S9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chmp5Q9D7S9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chmp5Q9D7S9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chmp5Q9D7S9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chmp5Q9D7S9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chmp5Q9D7S9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chmp5Q9D7S9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chmp5Q9D7S9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chmp5Q9D7S9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chmp5Q9D7S9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chmp5Q9D7S9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chmp5Q9D7S9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chmp5Q9D7S9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chmp5Q9D7S9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chmp5Q9D7S9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chmp5Q9D7S9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chmp5Q9D7S9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chmp5Q9D7S9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chmp5Q9D7S9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp5Q9D7S9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Chmp5Q9D7S9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Chmp5Q9D7S9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chmp5Q9D7S9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chmp5Q9D7S9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chmp5Q9D7S9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Chmp5Q9D7S9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chmp5Q9D7S9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chmp5Q9D7S9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chmp5Q9D7S9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chmp5Q9D7S9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chmp5Q9D7S9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chmp5Q9D7S9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chmp5Q9D7S9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms