Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn23Q9D7D7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn23Q9D7D7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn23Q9D7D7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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