Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Ccdc94Q9D6J3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Ccdc94Q9D6J3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Ccdc94Q9D6J3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Ccdc94Q9D6J3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Ccdc94Q9D6J3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Ccdc94Q9D6J3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Ccdc94Q9D6J3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Ccdc94Q9D6J3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ccdc94Q9D6J3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ccdc94Q9D6J3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25,22■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Ccdc94Q9D6J3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25,2■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Ccdc94Q9D6J3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,14■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Ccdc94Q9D6J3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Ccdc94Q9D6J3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Ccdc94Q9D6J3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,1 ms