Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc39Q9D5Y1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc39Q9D5Y1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc39Q9D5Y1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc39Q9D5Y1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc39Q9D5Y1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc39Q9D5Y1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc39Q9D5Y1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc39Q9D5Y1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms