Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tomm20lQ9D4V6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tomm20lQ9D4V6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tomm20lQ9D4V6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tomm20lQ9D4V6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tomm20lQ9D4V6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tomm20lQ9D4V6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tomm20lQ9D4V6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tomm20lQ9D4V6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tomm20lQ9D4V6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tomm20lQ9D4V6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tomm20lQ9D4V6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tomm20lQ9D4V6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tomm20lQ9D4V6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tomm20lQ9D4V6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tomm20lQ9D4V6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tomm20lQ9D4V6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tomm20lQ9D4V6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tomm20lQ9D4V6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tomm20lQ9D4V6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tomm20lQ9D4V6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms