Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt20Q9D312 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt20Q9D312 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt20Q9D312 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms