Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syf2Q9D198 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syf2Q9D198 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 470.4 ms