Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D131 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D131 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D131 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D131 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D131 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D131 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D131 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D131 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D131 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D131 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D131 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D131 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D131 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D131 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D131 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D131 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D131 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D131 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D131 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D131 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D131 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D131 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D131 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D131 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D131 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D131 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D131 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D131 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D131 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D131 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D131 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D131 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D131 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D131 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D131 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D131 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D131 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D131 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D131 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D131 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D131 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D131 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D131 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D131 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D131 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D131 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D131 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D131 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D131 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D131 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D131 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D131 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D131 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D131 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D131 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D131 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D131 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D131 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D131 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D131 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D131 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D131 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D131 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D131 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D131 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D131 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D131 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D131 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D131 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D131 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D131 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D131 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D131 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D131 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D131 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D131 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D131 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D131 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D131 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D131 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D131 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D131 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D131 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D131 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D131 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D131 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D131 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D131 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D131 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D131 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D131 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D131 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D131 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D131 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D131 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D131 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D131 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D131 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D131 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.6 ms