Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19,9■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,89■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,89■□□□□ 0,77
Cmss1Q9CZT6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Cmss1Q9CZT6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Cmss1Q9CZT6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Cmss1Q9CZT6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Cmss1Q9CZT6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19,88■□□□□ 0,77
Cmss1Q9CZT6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19,88■□□□□ 0,77
Cmss1Q9CZT6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Cmss1Q9CZT6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Cmss1Q9CZT6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,87■□□□□ 0,77
Cmss1Q9CZT6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,87■□□□□ 0,77
Cmss1Q9CZT6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19,86■□□□□ 0,77
Cmss1Q9CZT6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19,86■□□□□ 0,77
Cmss1Q9CZT6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,86■□□□□ 0,77
Cmss1Q9CZT6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Cmss1Q9CZT6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Cmss1Q9CZT6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Cmss1Q9CZT6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Cmss1Q9CZT6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Cmss1Q9CZT6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
Cmss1Q9CZT6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19,83■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19,82■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19,8■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,8■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,79■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19,78■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,77■□□□□ 0,76
Cmss1Q9CZT6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,76■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,76■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,76■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,76■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19,75■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19,75■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19,75■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19,74■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19,74■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,74■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Cmss1Q9CZT6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,8 ms