Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Utp23Q9CX11 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp23Q9CX11 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp23Q9CX11 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp23Q9CX11 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Utp23Q9CX11 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Utp23Q9CX11 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp23Q9CX11 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp23Q9CX11 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Utp23Q9CX11 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms