Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smc3Q9CW03 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smc3Q9CW03 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smc3Q9CW03 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smc3Q9CW03 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smc3Q9CW03 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smc3Q9CW03 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smc3Q9CW03 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smc3Q9CW03 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Smc3Q9CW03 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smc3Q9CW03 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smc3Q9CW03 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smc3Q9CW03 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smc3Q9CW03 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smc3Q9CW03 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smc3Q9CW03 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smc3Q9CW03 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smc3Q9CW03 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smc3Q9CW03 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smc3Q9CW03 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smc3Q9CW03 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smc3Q9CW03 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smc3Q9CW03 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Smc3Q9CW03 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Smc3Q9CW03 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Smc3Q9CW03 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Smc3Q9CW03 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smc3Q9CW03 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smc3Q9CW03 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smc3Q9CW03 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smc3Q9CW03 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smc3Q9CW03 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms