Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Sycp2Q9CUU3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Sycp2Q9CUU3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
Sycp2Q9CUU3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
Sycp2Q9CUU3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Sycp2Q9CUU3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
Sycp2Q9CUU3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
Sycp2Q9CUU3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Sycp2Q9CUU3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Sycp2Q9CUU3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
Sycp2Q9CUU3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
Sycp2Q9CUU3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
Sycp2Q9CUU3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
Sycp2Q9CUU3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
Sycp2Q9CUU3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
Sycp2Q9CUU3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
Sycp2Q9CUU3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Sycp2Q9CUU3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Sycp2Q9CUU3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Sycp2Q9CUU3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Sycp2Q9CUU3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Sycp2Q9CUU3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC43.58■■■■■ 4.57
Sycp2Q9CUU3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Sycp2Q9CUU3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Sycp2Q9CUU3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
Sycp2Q9CUU3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Sycp2Q9CUU3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Sycp2Q9CUU3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
Sycp2Q9CUU3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
Sycp2Q9CUU3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
Sycp2Q9CUU3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC43.52■■■■■ 4.56
Sycp2Q9CUU3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Sycp2Q9CUU3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Sycp2Q9CUU3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Sycp2Q9CUU3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Sycp2Q9CUU3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC43.49■■■■■ 4.55
Sycp2Q9CUU3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
Sycp2Q9CUU3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Sycp2Q9CUU3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
Sycp2Q9CUU3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Sycp2Q9CUU3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Sycp2Q9CUU3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC43.48■■■■■ 4.55
Sycp2Q9CUU3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
Sycp2Q9CUU3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
Sycp2Q9CUU3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
Sycp2Q9CUU3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
Sycp2Q9CUU3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
Sycp2Q9CUU3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Sycp2Q9CUU3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
Sycp2Q9CUU3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.55
Sycp2Q9CUU3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Sycp2Q9CUU3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Sycp2Q9CUU3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
Sycp2Q9CUU3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Sycp2Q9CUU3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Sycp2Q9CUU3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
Sycp2Q9CUU3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
Sycp2Q9CUU3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
Sycp2Q9CUU3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
Sycp2Q9CUU3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Sycp2Q9CUU3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
Sycp2Q9CUU3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
Sycp2Q9CUU3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
Sycp2Q9CUU3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
Sycp2Q9CUU3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
Sycp2Q9CUU3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Sycp2Q9CUU3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Sycp2Q9CUU3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
Sycp2Q9CUU3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Sycp2Q9CUU3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Sycp2Q9CUU3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Sycp2Q9CUU3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Sycp2Q9CUU3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Sycp2Q9CUU3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Sycp2Q9CUU3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Sycp2Q9CUU3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC43.24■■■■■ 4.51
Sycp2Q9CUU3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Sycp2Q9CUU3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Sycp2Q9CUU3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Sycp2Q9CUU3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Sycp2Q9CUU3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Sycp2Q9CUU3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
Sycp2Q9CUU3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
Sycp2Q9CUU3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Sycp2Q9CUU3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
Sycp2Q9CUU3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
Sycp2Q9CUU3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
Sycp2Q9CUU3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
Sycp2Q9CUU3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
Sycp2Q9CUU3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Sycp2Q9CUU3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Sycp2Q9CUU3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Sycp2Q9CUU3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Sycp2Q9CUU3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC43.15■■■■■ 4.5
Sycp2Q9CUU3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
Sycp2Q9CUU3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
Sycp2Q9CUU3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
Sycp2Q9CUU3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
Sycp2Q9CUU3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms