Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smc1aQ9CU62 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smc1aQ9CU62 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smc1aQ9CU62 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smc1aQ9CU62 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smc1aQ9CU62 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smc1aQ9CU62 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smc1aQ9CU62 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smc1aQ9CU62 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms