Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rhobtb3Q9CTN4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms