Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp13a2Q9CTG6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms