Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS4

Slc25a46, Solute carrier family 25 member 46, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a46Q9CQS4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc25a46Q9CQS4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc25a46Q9CQS4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc25a46Q9CQS4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc25a46Q9CQS4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc25a46Q9CQS4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc25a46Q9CQS4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc25a46Q9CQS4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc25a46Q9CQS4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc25a46Q9CQS4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms