Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chchd5Q9CQP3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chchd5Q9CQP3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chchd5Q9CQP3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms