Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trappc2Q9CQP2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc2Q9CQP2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc2Q9CQP2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms