Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CQM1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CQM1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CQM1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9CQM1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9CQM1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CQM1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CQM1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CQM1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CQM1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CQM1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CQM1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CQM1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CQM1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CQM1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CQM1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CQM1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CQM1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CQM1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CQM1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CQM1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CQM1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CQM1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CQM1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CQM1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CQM1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CQM1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CQM1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CQM1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CQM1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CQM1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CQM1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CQM1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CQM1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CQM1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CQM1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CQM1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CQM1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CQM1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CQM1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CQM1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9CQM1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9CQM1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9CQM1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9CQM1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9CQM1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9CQM1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9CQM1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms