Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed6Q9CQG0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed6Q9CQG0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed6Q9CQG0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed6Q9CQG0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed6Q9CQG0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed6Q9CQG0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed6Q9CQG0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed6Q9CQG0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed6Q9CQG0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmed6Q9CQG0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmed6Q9CQG0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmed6Q9CQG0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed6Q9CQG0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed6Q9CQG0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms