Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4921530L21RikQ9CQ47 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4921530L21RikQ9CQ47 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4921530L21RikQ9CQ47 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms