Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
StambpQ9CQ26 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
StambpQ9CQ26 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
StambpQ9CQ26 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
StambpQ9CQ26 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
StambpQ9CQ26 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
StambpQ9CQ26 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
StambpQ9CQ26 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
StambpQ9CQ26 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
StambpQ9CQ26 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
StambpQ9CQ26 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
StambpQ9CQ26 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
StambpQ9CQ26 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
StambpQ9CQ26 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
StambpQ9CQ26 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
StambpQ9CQ26 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
StambpQ9CQ26 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
StambpQ9CQ26 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
StambpQ9CQ26 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
StambpQ9CQ26 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
StambpQ9CQ26 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
StambpQ9CQ26 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
StambpQ9CQ26 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
StambpQ9CQ26 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
StambpQ9CQ26 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
StambpQ9CQ26 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
StambpQ9CQ26 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
StambpQ9CQ26 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
StambpQ9CQ26 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
StambpQ9CQ26 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
StambpQ9CQ26 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
StambpQ9CQ26 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
StambpQ9CQ26 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
StambpQ9CQ26 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
StambpQ9CQ26 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
StambpQ9CQ26 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms