Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt88Q9CPR6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt88Q9CPR6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt88Q9CPR6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt88Q9CPR6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt88Q9CPR6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt88Q9CPR6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt88Q9CPR6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt88Q9CPR6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt88Q9CPR6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt88Q9CPR6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt88Q9CPR6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt88Q9CPR6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt88Q9CPR6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt88Q9CPR6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt88Q9CPR6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt88Q9CPR6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt88Q9CPR6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt88Q9CPR6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms