Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt23Q99PS0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt23Q99PS0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt23Q99PS0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt23Q99PS0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt23Q99PS0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt23Q99PS0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt23Q99PS0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt23Q99PS0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt23Q99PS0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt23Q99PS0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt23Q99PS0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt23Q99PS0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt23Q99PS0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt23Q99PS0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt23Q99PS0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt23Q99PS0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt23Q99PS0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt23Q99PS0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt23Q99PS0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt23Q99PS0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt23Q99PS0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt23Q99PS0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt23Q99PS0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt23Q99PS0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Krt23Q99PS0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt23Q99PS0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Krt23Q99PS0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt23Q99PS0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt23Q99PS0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt23Q99PS0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt23Q99PS0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt23Q99PS0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt23Q99PS0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt23Q99PS0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt23Q99PS0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt23Q99PS0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt23Q99PS0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt23Q99PS0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt23Q99PS0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt23Q99PS0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt23Q99PS0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt23Q99PS0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt23Q99PS0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt23Q99PS0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt23Q99PS0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt23Q99PS0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt23Q99PS0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt23Q99PS0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt23Q99PS0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt23Q99PS0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt23Q99PS0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt23Q99PS0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt23Q99PS0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt23Q99PS0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt23Q99PS0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt23Q99PS0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt23Q99PS0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt23Q99PS0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt23Q99PS0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt23Q99PS0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt23Q99PS0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt23Q99PS0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt23Q99PS0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt23Q99PS0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt23Q99PS0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt23Q99PS0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt23Q99PS0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt23Q99PS0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms