Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep41Q99NF3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cep41Q99NF3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cep41Q99NF3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms