Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atoh8Q99NA2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atoh8Q99NA2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atoh8Q99NA2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atoh8Q99NA2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atoh8Q99NA2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atoh8Q99NA2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atoh8Q99NA2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atoh8Q99NA2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atoh8Q99NA2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atoh8Q99NA2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atoh8Q99NA2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atoh8Q99NA2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atoh8Q99NA2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atoh8Q99NA2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atoh8Q99NA2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atoh8Q99NA2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atoh8Q99NA2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atoh8Q99NA2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atoh8Q99NA2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atoh8Q99NA2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atoh8Q99NA2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atoh8Q99NA2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atoh8Q99NA2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atoh8Q99NA2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atoh8Q99NA2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atoh8Q99NA2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atoh8Q99NA2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atoh8Q99NA2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atoh8Q99NA2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atoh8Q99NA2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atoh8Q99NA2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atoh8Q99NA2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atoh8Q99NA2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atoh8Q99NA2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atoh8Q99NA2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atoh8Q99NA2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atoh8Q99NA2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atoh8Q99NA2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atoh8Q99NA2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atoh8Q99NA2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Atoh8Q99NA2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atoh8Q99NA2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms