Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl3Q99N95 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl3Q99N95 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl3Q99N95 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms