Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99M08 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99M08 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99M08 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99M08 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99M08 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99M08 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99M08 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99M08 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99M08 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99M08 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99M08 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99M08 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99M08 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99M08 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99M08 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99M08 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99M08 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99M08 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99M08 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99M08 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99M08 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99M08 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99M08 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q99M08 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q99M08 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q99M08 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q99M08 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q99M08 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q99M08 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q99M08 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q99M08 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99M08 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99M08 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q99M08 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q99M08 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q99M08 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99M08 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99M08 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99M08 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99M08 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99M08 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99M08 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99M08 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99M08 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99M08 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99M08 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99M08 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99M08 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99M08 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99M08 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99M08 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99M08 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99M08 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99M08 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99M08 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99M08 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99M08 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99M08 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99M08 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99M08 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99M08 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q99M08 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q99M08 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99M08 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99M08 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99M08 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99M08 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99M08 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99M08 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99M08 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99M08 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99M08 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99M08 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99M08 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99M08 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99M08 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99M08 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99M08 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99M08 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99M08 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99M08 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99M08 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99M08 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99M08 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99M08 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99M08 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99M08 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99M08 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99M08 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99M08 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99M08 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99M08 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99M08 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99M08 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99M08 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99M08 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99M08 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99M08 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99M08 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms