Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clcc1Q99LI2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcc1Q99LI2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcc1Q99LI2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms