Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nmd3Q99L48 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nmd3Q99L48 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms