Protein–RNA interactions for Protein: Q99KS2

Ngrn, Neugrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgrnQ99KS2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NgrnQ99KS2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NgrnQ99KS2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NgrnQ99KS2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NgrnQ99KS2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NgrnQ99KS2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NgrnQ99KS2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NgrnQ99KS2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NgrnQ99KS2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NgrnQ99KS2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NgrnQ99KS2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NgrnQ99KS2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NgrnQ99KS2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NgrnQ99KS2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NgrnQ99KS2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NgrnQ99KS2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NgrnQ99KS2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NgrnQ99KS2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NgrnQ99KS2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NgrnQ99KS2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgrnQ99KS2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NgrnQ99KS2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NgrnQ99KS2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NgrnQ99KS2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NgrnQ99KS2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NgrnQ99KS2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgrnQ99KS2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NgrnQ99KS2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NgrnQ99KS2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NgrnQ99KS2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NgrnQ99KS2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NgrnQ99KS2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NgrnQ99KS2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NgrnQ99KS2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms