Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl22Q99JN2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl22Q99JN2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms