Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk9Q99J95 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdk9Q99J95 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk9Q99J95 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk9Q99J95 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms