Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddb2Q99J79 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddb2Q99J79 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddb2Q99J79 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddb2Q99J79 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddb2Q99J79 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddb2Q99J79 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddb2Q99J79 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddb2Q99J79 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddb2Q99J79 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddb2Q99J79 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddb2Q99J79 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddb2Q99J79 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddb2Q99J79 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddb2Q99J79 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddb2Q99J79 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddb2Q99J79 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddb2Q99J79 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddb2Q99J79 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddb2Q99J79 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddb2Q99J79 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddb2Q99J79 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Ddb2Q99J79 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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