Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc30a1Q99J38 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc30a1Q99J38 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc30a1Q99J38 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc30a1Q99J38 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc30a1Q99J38 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc30a1Q99J38 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc30a1Q99J38 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc30a1Q99J38 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc30a1Q99J38 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc30a1Q99J38 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc30a1Q99J38 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc30a1Q99J38 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc30a1Q99J38 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc30a1Q99J38 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc30a1Q99J38 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc30a1Q99J38 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc30a1Q99J38 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc30a1Q99J38 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ttc30a1Q99J38 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc30a1Q99J38 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc30a1Q99J38 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc30a1Q99J38 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms