Protein–RNA interactions for Protein: Q924W5

Smc6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc6Q924W5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc6Q924W5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Smc6Q924W5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smc6Q924W5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc6Q924W5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc6Q924W5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc6Q924W5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc6Q924W5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Smc6Q924W5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smc6Q924W5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smc6Q924W5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smc6Q924W5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smc6Q924W5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc6Q924W5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc6Q924W5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc6Q924W5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smc6Q924W5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms