Protein–RNA interactions for Protein: Q923Z4

Ferd3l, Fer3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ferd3lQ923Z4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ferd3lQ923Z4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ferd3lQ923Z4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ferd3lQ923Z4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ferd3lQ923Z4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ferd3lQ923Z4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ferd3lQ923Z4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ferd3lQ923Z4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ferd3lQ923Z4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ferd3lQ923Z4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ferd3lQ923Z4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ferd3lQ923Z4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms